微生物群落多样性测序与功能分析(6)

RDA 是基于线性模型，CCA是基于单峰模型。分析可以检测环境因子、样品、菌群三者之间的关系或者两两之间的关系。

横轴和纵轴：RDA 和CCA 分析，模型不同，横纵坐标上的刻度为每个样品或者物种在与环境因子进行回归分析计算时产生的值，可以绘制于二维图形中。

图解读：冗余分析可以基于所有样品的OTU作图，也可以基于样品中优势物种作图；

箭头射线：箭头分别代表不同的环境因子；

夹角：环境因子之间的夹角为锐角时表示两个环境因子之间呈正相关关系，钝角时呈负相关关系。环境因子的射线越长，说明该影响因子的影响程度越大； 不同颜色的点表示不同组别的样品或者同一组别不同时期的样品，图中的拉丁文代表物种名称，可以将关注的优势物种也纳入图中； 环境因子数量要少于样本数量，同时在分析时，需要提供环境因子的数据，比如 pH值，测定的温度值等。

23. 有其他问题可以联系谷禾信息。

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注意事项

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假设您要对人体肠道微生物菌群进行测序，一般可以选择对粪便进行取样。

一般建议采取新鲜样品，因为微生物本身是活的群体，样品长期保存或不在原环境下保存会改变原有菌群的构成，最终导致我们得到的菌群构成发生偏差。比如粪便样品如果4度低温保存了一段时间，则其中部分耐低温的菌可能仍然在持续繁殖，这样最终样品的菌群会发生偏差。如果是送往公司测序也建议首先对样品进行DNA提取后再寄送，因为原始样品的寄送过程也可能导致菌群变化。