yeast-two-hybrid(中文版)(3)
C.Sperm DNA(10mg/ml) 10ul 200ul 2.0ml
1´TE/LiAc重悬感受态细胞 1.5ml 1.0ml 8.0ml
酵母感受态细胞 100ul´20 1.0ml 8.0ml
加PEG/LiAc,剧烈振荡 0.6ml´20 6.0ml 60.0ml 加DMSO,轻柔混匀 70ul´20 700ul 7.0ml 室温离心后弃上清 14000rpm´5sec 2500rpm´5min 2500rpm´5min 1´TE重悬感受态细胞 0.1ml´20 6.0ml 10.0ml 铺固体选择培养基平板 φ90mm´20 φ150mm´50 φ150mm´50 5. 6. 7. 8. 9. 10.
yeast-two-hybrid(中文版)
注:小规模转化用于:(1)检验DNA-BD/bait 有无自身激活报道基因的能力;
(2)观测 DNA-BD/bait对宿主的毒性作用;
(3)对照实验;
(4)筛库前先转入DNA-BD/bait;
大规模、库规模转化用于:转入文库质粒或同时转化两种质粒筛库;
转化子的筛选与库质粒纯化
一. 培养基:
SD/-Trp-Leu-His-Ade/3-AT/X-α-GAL 固体培养基 (121°C,灭菌15min)
A. SD Agar Base (Clontech 公司) 4.67g
B. 10 ´ DO (-Leu-Trp-His-Ade) (Clontech 公司) 10.0 ml
C. ddH2O ® 100.0 ml
121°C,灭菌15min,冷却到50℃加入适量5M 3-AT(至终浓度15mM)与100ul X-α-GAL(20mg/ml),铺5块平板(90-100mm)
65%甘油-硫酸镁缓冲液
A. 甘油 65ml
B. Mg2SO4·2H2O 2.465g
C. 2.0M Tris·HCl 1.25ml
D. ddH2O ® 100.0ml
二. 实验步骤:
1. 选择菌落数30-300的滴度平板计算转化效率与克隆总数:
假设100ug库质粒转化时重悬菌液10ml, 以100ul菌液涂布的1:100的滴度板上菌
落数100,则:
转化效率:
克隆总数:
2. 筛库要求克隆总数超过文库克隆数(胎肝库为1.6´106克隆)的十倍;若克隆总数
低于106则需重新转化;
3. 将平板移至4°C冰箱,固化琼脂3-4小时;
yeast-two-hybrid(中文版)
4. 超净台中,向每块平板滴加5ml 1´TE,用涂布棒刮下菌落,收集于50ml离心管;
5. 室温离心2500rpm´5min,弃上清。用无菌双蒸水反复洗涤3-5次;
6. 保存菌种:每管取0.5ml菌液与0.5ml 65%甘油 硫酸镁混匀,-70°C冻存;
7. 取适量菌液(使克隆总数达文库滴度的5-10倍),涂布SD/ -Trp-Leu-His-Ade筛选
平板,30°C倒置培养3-5天至菌落出现;
8. 挑取菌落点种到SD/ -Trp-Leu-His-Ade/3-AT/X-α-GAL平板,30°C倒置温育,显兰
色的菌落即阳性候选克隆;
9. 阳性候选克隆分区划线接种于SD/ -Trp-Leu /X-α-GAL平板上,30°C倒置温育3
天,使同一酵母菌中几种库质粒分离;
10. 挑取再次显兰色菌落重复上一步;
11. 此次所得兰色菌落点种于SD/ -Trp-Leu-His-Ade/3-AT/X-α-GAL平板,30°C倒置温
育1-2天,显兰色的菌落即可用于质粒提取鉴定。
yeast-two-hybrid(中文版)
酵母双杂合系统阳性克隆的鉴定
—— 酵母质粒DNA的提取
一. 试剂与培养基:
SD/-Leu培养液,(121°C,灭菌15min)
A. SD Base (Clontech 公司) 2.67g
B. 10 ´ DO (-Leu-Trp) 10.0 ml
C. 20 ´Trp 5.0 ml
D. ddH2O ® 100.0 ml
酵母裂解液:2%Triton X-100; 1% SDS; 100mM NaCl; 10mM Tris,pH8.0; 1mM EDTA
A. 10% Triton X-100 20.0ml
B. 10%SDS 10.0ml
C. NaCl 0.58g
D. Tris 0.12g
E. EDTANa2·2H2O 0.12g
F. 1.0N HCl → pH8.0
G. ddH2O → 100.0ml
二. 实验步骤:
1. 挑取经过酵母营养缺陷平板筛选并分离的兰色酵母单菌落,接种于5.0ml SD/-Leu
液体培养基,30°C恒温,250rpm振荡培养1-2天,使丢失pGBKT7/bait 质粒;
2. 室温离心5000rpm×1min,弃上清;
3. 加入酵母裂解液200ul,振荡重悬菌团;
4. 加入玻璃珠(sigma)0.2g,苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)0.2ml, 涡流振荡5min;
5. -70℃保存过夜或液氮冻存10 min;
6. 室温复融,再振荡5 min;
7. 室温离心12000 rpm×10min,上清转移至新的1.5 ml离心管中,加入3MNaAc
(1/10V)20ul,无水乙醇(2.5V)500ul,-70℃冻存30-60min;
8. 离心12500 rpm×10min,4℃,弃上清;70%乙醇洗涤沉淀,于37℃烘箱或超净台
干燥DNA;以20-30ul无菌ddH2O重悬DNA,保存于-20℃。
yeast-two-hybrid(中文版)
大肠杆菌感受态细胞的制备(电转化)
一.培养基:
SOB液体培养基,115℃,101b/in2灭菌15min
A. bacto-Tryptone 10.0g
B. bacto-Yeast Extract 2.5g
C. NaCl 0.25g
D. KCl 0.09g
E. MgCl2·6H2O 1.02g
F. ddH2O → 500.0ml
二. 实验步骤:
1. 挑取LB固体培养基上生长的E.coliKC8单菌落,接种于5ml LB液体培养基中,37℃恒
温,250 rpm振荡培养过夜;
2. 将2.5ml新鲜菌液接种于500mlSOB培养液中,37℃恒温,250 rpm振荡培养至
OD600=0.5-0.6(约2.5-3hr);
3. 将培养菌液收集于离心管中,冰水浴15-20min;
4. 离心6000 rpm×10min,4℃,弃上清;以5ml预冷的无菌ddH2O重悬菌团,再加入500ml
预冷的无菌ddH2O洗涤沉淀细菌;
5. 重复上述步骤1次,以充分去除培养基中残余的盐离子成分;
6. 用40-50ml预冷的无菌10%甘油重悬沉淀细菌,转移至50ml无菌离心管中,离心6000
rpm×10min,4℃,弃上清;重复此步骤1次;
7. 以等体积(约1.5-2.0ml)预冷的无菌10%甘油重悬上述沉淀的感受态细胞,分装200ul/
管(5次转化反应),冻存于-70℃备用。
文库质粒DNA电转化大肠杆菌E.coliKC8
1. 冰浴条件下,取2ul待转化质粒DNA加入40ul感受态细胞中,混匀;
2. 加入间距0.1cm样品杯,电转化(1.8KV,25uF,200Ω);
3. 迅速加入1ml新鲜LB培养液,混匀,转入1.5ml离心管,37℃恒温,250rpm振摇孵育
1h;
4. 离心2500rpm×5min,4℃,弃上清,保留100ul菌液涂布LB/Amp平板,37℃倒置温育。
yeast-two-hybrid(中文版)
碱裂解法小量制备细菌质粒DNA
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