diamond 3 教程系列1.01 - 图文(3)
图2.12 右键点选下的Lasso Selection操作
图2.13 Lasso Selection操作轨迹图
第三节 View 系列菜单
3.1 View 系列菜单简介
该系列菜单包含了所有“查看”信息,包括操作文档的大纲及缩略图、晶体学参数及列表、原子及键的信息列表(其中还可以进行选择)、粉末图显示、数据/图片切换等功能。
3.1 典型的View 操作界面
3.2 常用选项介绍
3.2.1 Navigation 和Thumbnails
这两项功能分别提供了目录(大纲)和缩略图功能。
图3.2 Navigation效果图
图3.3 Navigation选项
Navigation后在左侧显示出了各个菜单的名称主要包括五项。 ?点击Structure x 可以显示当前操作的结构图:
图3.4点击Structure x效果
?点击Data sheet可以显示该结构的晶体学信息:
图3.5 Data sheet 列表信息
这些信息可以打印或直接拷贝到其它文档处理软件,并直接列表,这些信息可以直接用于文章的发表。比如,选择-复制-拷贝到本教程后的信息如下:
表3-1 Data sheet 列表信息
General
Origin Code
Database dates Common name Systematic name
Structure 1
Structural formula Analytical formula
Bibliographic data
Author(s) Publication title Citation Mineral name
Compound source Structure type Creation method Comments
Phase data
Formula sum Formula weight Crystal system Space-group Cell parameters Cell ratio Cell volume Z
Calc. density Meas. density Melting point RAll RObs
Pearson code Formula type
H40 C64 809.02 g/mol monoclinic P 1 21/a 1 (14)
a=12.3027 ? b=9.9879 ? c=8.2206 ? β=96.40° a/b=1.2318 b/c=1.2150 c/a=0.6682
31003.83 ?
Created with Diamond v2.0
1.33821 g/cm3 mP104 N5O8
Wyckoff sequence e26
Atomic parameters ,Anisotropic displacement parameters, in ?2列表限于篇幅,不再列出。
?点击Distance/angles,则给出一格相当详细的信息表。
表3-2 Distance/angles操作界面说明 Select atom (type)s 可以选择参与列表的原子种类 Unit 表示选择范围的单位,?表示埃,下面依次是皮米和纳米 Dmin Dmax 表示选定的原子该范围球壳范围内的所有原子,默认值是0-2.5?。 angle d 1,2 and 1,3 Count 该选项提供了在设定球壳内与之相关的原子所组成的夹角,具体操作见后面说明。 该选项只能与angle选项共同使用,不能单独选择,列出了在angle选项中构成角度的三个原子间的距离 对选型范围内重复出现的原子累计计数,在选择的半径较小时,一般为1×,如果调大Dmax,有的原子可能在该范围内出现多次,表示为2×,3×等。 列出对称操作 H10 C14 原子坐标 13555011 1.0664 红字部分就是原子代码 Symmetry op. Atom code Coordinate Standard Uncertainties 选择该项会使得2.0295数值显示成2.0295(25) ,25就是s.u.值,(s.u.值) 但前提是胆经数据本身必须提供该值,否则程序不会计算该值。
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