diamond 3 教程系列1.01 - 图文(2)

功能可以实现结构的对接，但是必须要注意的是不同结构可能由于空间群的不同无法实现对接，这是可以采用如下的方法：

新建一个空文档>>打开C60结构文件：调解两个窗口的大小以适合显示：直接复制C60结构，粘贴到pyrene文档中，无法实现，相反的复制-粘贴过程也被警告无法进行。提示如下（图2.3）：

图2.3 结构复制时对称操作信息必须考虑

图2.4结构复制时消除对称操作

通过对pyrene文档Structure>>Remove Translational Symmetry（图2.4）消除了对称操作后，选择，复制并粘贴C60结构，得到如下结果：

图2.5 结构的对接

很明显，这时新的结构并没有任何对称操作，需要增加对称操作。那么，反过来，将消除了对称操作的pyrene粘贴到C60文档中，仍然不被允许。对接的技巧，读者可以自己试验，这样不必在设计结构时一个一个原子的输入，大大节省了我们的时间。Paste 选项仅仅能实现结构的粘贴，并不能实现外部数据（如图片或结构）的导入。 2.2.3 Copy Style及Paste Style选项：

该选项可以实现将某些设定好的类型选项直接通过类似Word 中格式刷的功能进行类型更换。操作起来可以首先选择某个原子或键，然后点击Copy Style，然后再选择一些原子或键，点击Paste Style：

图2.6 右键点选下的Copy Style操作

图2.7 Paste Style操作

图2.8 Copy>>Paste Style操作后的效果

由于我们在Paste Style操作中选择了部分H原子，使得这部分的原子的颜色和半径都和碳原子一样，但仍需注意，Style的复制粘贴只限于原子或键的格式，并不能复制粘贴原子的种类，换句话说，那些氢原子格式发生了改变，但仍是氢原子。 这两种功能在细化处理时很有效，不必一个一个原子的去设置，同时又避免了大面积选择时的失误操作。

2.2.4 Select系列操作：

Select all 就不必介绍了；Invert Selection 是常用的功能，比如我们在处理一个很复杂的结构时，需要改变其中一个较大部分的类型，很明显，Select all无法实现，而一一选择费时

且在diamond中目前仍必须按住Ctrl，才可以复选或多选原子，数目太多，容易前功尽弃，这时，我们可以通过先选择较少部分，然后Invert Selection来实现。

Select Molecule(s) 该功能中所说的分子并不等同于在其它软件中的分子。本软件中，只要成键，就被认为是分子中的一部分，同时，一个分子中的部分如果键被打断则被认为是不同分子。这种功能非常实用，尤其是在配位聚合物的结构分析中。

图2.8例图

如图2.8中所示的红色键，是人为加入的一条键，当左键点击选择相互连接的两个分子时，程序认为这其实是一个分子。

图2.9 右键点选下的Select Molecule(s)操作

图2.10 Select Molecule(s)操作效果图

该功能的快捷操作还可以用鼠标右键中的Select Molecule(s)选项：

图2.11 左键点选下的Select Molecule(s)快捷操作

Lasso Selection 该功能与Photoshop、Chemdraw的功能非常相似，可以实现精挑细选，而不像按住左键进行方框选择功能那样笨拙，操作时，和其它软件一样，选择完毕后必须回到出发点才结束一次选择。