宝生物工程(大连)有限公司 One Step PrimeScript® miRN
TaKaRa Code:D350A
One Step PrimeScript®
miRNA cDNA Synthesis Kit (Perfect Real Time)
(20次量)
宝生物工程(大连)有限公司
目 录
内 容
页 码
● 制品说明 ● 制品内容 ● 保 存
● 需要准备的其他试剂 ● 试剂盒原理 ● 特 长 ● RNA样品制备 ● 操作注意 ● 操作方法
1.Poly(A)加尾反应和反转录反应 2.Real Time PCR反应
◆应用Thermal Cycler Dice Real Time System扩增仪的操作方法 ◆应用ABI PRISM 7000/7700/7900 HT,
7300/7500/7500 Fast Real-Time PCR System的操作方法 ◆应用LightCycler Real Time PCR扩增仪的操作方法 ● 实验条件的选择 ● 实验例 ● 引物设计说明 ● 问 答
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● 制品说明
本制品中含有合成Poly(A)多聚尾和合成cDNA所需的全部试剂,可以将样品中的miRNA(起始样品可以是Total RNA、small RNA fragments等任何包含miRNA的样品)经过一次反应合成为1st Strand cDNA(样品中的mRNA、snoRNA等其它形式的RNA也会同时被反转录成cDNA)。本试剂盒经过特别的优化,将Poly(A)加尾反应和cDNA合成反应同步进行,在1小时内即可完成miRNA 1st Strand cDNA合成,且产物(TaKaRa Code:无需进行纯化,可直接使用PCR反应试剂SYBR Premix Ex Taq II(Perfect Real Time)
DRR081)进行Real Time PCR定量检测,从而准确简便地对miRNA(或mRNA、snoRNA等其它RNA分子)进行表达量分析。由于本试剂盒对反应样品进行的Poly(A)加尾以及cDNA合成不具有特异性,所以经过一次反转录得到的产物可以用于多种miRNA以及mRNA、snoRNA等的定量分析。
本制品可以从10 pg~5 μg Total RNA反转录合成miRNAs、mRNAs和snoRNA等的1st Strand cDNA,再通过Real Time PCR反应,可以在宽广的定量区域内得到良好的标准曲线,对靶基因进行准确定量、检测,重复性好,可信度高。
● 制品内容(20 μl反应×20次)
1. 2×miRNA Reaction Buffer Mix(for Real Time)*1 Enzyme Mix 2. miRNA PrimeScript® RT
3. 0.1% BSA 4. Uni-miR qPCR Primer(10 μM) 5. RNase free dH2O 6. Easy Dilution(for Real Time PCR)*2
*1 含有dNTP Mixture、Mg2+和反转录用的Universal Adaptor Primer。
200 μl 40 μl 40 μl 200 μl 1 ml×2 1 ml
*2 制作标准曲线时梯度稀释DNA或RNA标准品的稀释液。模板DNA或模板RNA如果用水或TE
稀释时,由于受Microtube的吸附作用等原因的影响,往往不能准确地进行稀释,导致实验结果精度降低。使用本制品时,即使稀释至低浓度也能够进行准确地稀释,容易在宽广范围内获得准确定量的标准曲线。EASY Dilution也可以单独购买(TaKaRa Code:D9160)。
EASY Dilution请与本公司Real Time PCR试剂组合使用,对于其他公司同类制品的适用性本公司尚未进行确认。
● 保 存: -20℃。 ● 需要准备的其他试剂
SYBR Premix Ex Taq II(Perfect Real Time)(TaKaRa Code:DRR081)
● 试剂盒原理
1.
反转录反应
试剂盒中的miRNA PrimeScript® RT Enzyme Mix中包含Poly(A) Polymerase和反转录酶PrimeScript® RTase,两种酶经过优化达到最佳比例。试剂盒中的2×miRNA Reaction Buffer Mix中包含反应所需的dNTP Mixture、Mg2+和反转录用的Universal Adaptor Primer等,其组份也是根据miRNA PrimeScript® RT Enzyme Mix进行了优化调整,使上述两种酶都可以达到最佳活力。
如原理图1所示,与mRNA不同,miRNA不具有Poly(A)结构,但在本试剂盒的反转录反应中,可以同时对样品中的miRNA以及其它small noncoding RNA进行Poly(A)加尾反应,然后利用Universal Adaptor Primer(含有oligo-dT)将经过Poly(A)加尾的RNA以及mRNA进行反转录反应得到cDNA,并引入了Uni-miR qPCR Primer的结合位点,利用这一位置可以对样品中任何cDNA进行定量PCR反应。
-1-
2. 定量PCR反应
反转录结束后,采用SYBR Green I嵌合荧光法对合成的cDNA进行定量分析。Real Time PCR扩增反应可以采用如图2显示的SYBR Green I嵌合荧光法,即在反应体系中加入与双链DNA结合便可发出荧光的荧光染料SYBR Green I,通过检测PCR反应液中的荧光信号强度,可以对目的基因进行准确定量,同时还可以测定扩增的目的DNA片段的融解温度。客户可以使用试剂盒中提供的Uni-miR qPCR Primer及自行设计的miRNA Specific Forward Primer对miRNA进行定量解析,且使用一次合成的cDNA就可以同时对多个miRNA或者snoRNA、mRNA等分子进行检测。
图1. miRNA定量原理图
图2. 嵌合荧光法原理图
-2-
● 特 长
1. Poly(A)加尾反应和反转录反应在同一Tube中同时进行,在较短的时间内高效合成miRNA Real Time
PCR用的cDNA,可以快速、准确地对miRNA进行表达分析,是进行miRNA Real Time RT-PCR反应的最佳试剂。
2. 使用一次合成的cDNA就可以同时对多个miRNA或者snoRNA、mRNA等分子进行检测。
3. 制品中附加了标准曲线制作用稀释液EASY Dilution(for Real Time PCR),将Total RNA或cDNA稀
释至低浓度也能够进行准确稀释,容易在宽广范围内获得准确定量的标准曲线。
● RNA样品制备
本制品是将RNA反转录成cDNA的专用试剂。RNA的纯度会影响cDNA的合成量,而制备RNA的关键是要抑制细胞中的RNA分解酶和防止所用器具及试剂中的RNA分解酶的污染。因此,在实验中必须采取以下措施:戴一次性干净手套;使用RNA操作专用实验台;在操作过程中避免讲话等等。通过以上办法可以防止实验者的汗液、唾液中的RNA分解酶的污染。
【使用器具】
尽量使用一次性塑料器皿,若用玻璃器皿,应在使用前按下列(1)或者(2)方法进行处理。 (1)干热灭菌(180℃,60 min)
(2)用0.1% DEPC(焦碳酸二乙酯)水溶液在37℃下处理12小时。然后在120℃下高压灭菌30分钟
以除去残留的DEPC。
RNA实验用的器具和仪器建议专门使用,不要用于其它实验。
【试剂配制】
用于RNA实验的试剂,需使用干热灭菌(180℃,60 min)或用上述方法进行DEPC水处理灭菌后的玻璃容器盛装(也可使用RNA实验用的一次性塑料容器),使用的无菌水需用0.1%的DEPC处理后进行高温高压灭菌。
RNA实验用的试剂和无菌水都应专用,避免混用后交叉污染。
【制备方法】
使用如RNAiso Plus(TaKaRa Code: D9108)等传统的RNA纯化方法即可获得满足于本试剂盒反应的miRNA(只需少量的miRNA便可进行RT-PCR反应),或者可以使用其它任何可以保障small RNA在提取过程中不会丢失的方法。为了提高反应的灵敏度,也可以使用其它small RNA富集、纯化等方法。
【Total RNA中混有基因组DNA的对策】
提取的Total RNA中常常混有基因组DNA,而基因组DNA可以直接作为P …… 此处隐藏:3289字,全部文档内容请下载后查看。喜欢就下载吧 ……
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